Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

Eigen tools by Nick Patterson and Alkes Price lab

DReichLab/EIG è adatto ai principianti?

Abbiamo visto troppo poche pull request recenti di contributori esterni su DReichLab/EIG per dire quanto spesso vengono accettate. Al momento non è aperta nessuna issue adatta ai principianti; l'elenco qui sotto mostra le altre issue che abbiamo per questo repository.

Stelle
207
Fork
61
Issue aperte per principianti
0
Issue indicizzate
58
Lingua principale
C
Licenza
Nessun dato sulla licenza
Ultimo push su GitHub
20/7/2026
Ultima indicizzazione
20/9/2026
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta
Nessun codice di condotta
Label per principianti
Nessuna label per principianti indicizzata
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Come contribuire a DReichLab/EIG

  1. Non c'è una guida per contribuire: parti dal README e da alcune pull request accettate di recente per capire come si propongono le modifiche.
  2. Segui il repository per sapere quando si apre una nuova issue adatta ai principianti, oppure guarda le altre issue qui sotto.
Caricamento delle issue

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • Question Regarding SNP Count After Merging Genotype Files
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#114 · 1 commento ·

  • Undefined behavior in PACKEDANCESTRYMAP hash code
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100

    DReichLab/EIG#113 · 1 commento ·

  • How is estimated the genetic distance
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#112 ·

  • smartpca: LAPACKE_dlange issue
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    DReichLab/EIG#110 · 1 commento ·

  • Query about renaming first column of IND file
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

    DReichLab/EIG#107 · 1 commento ·

  • elliptical confidence not calculated
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

    DReichLab/EIG#106 · 3 commenti ·

  • convertf exporting to PACKEDPED
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#105 · 1 commento ·

  • numsnps output:0
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#104 · 1 commento ·

  • FST details (by SNP FST) not printed
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#102 · 4 commenti ·

  • (getpedgenos) all.filter.ped bad geno *
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#101 · 1 commento ·

  • Questions regarding multithreading
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#96 ·

  • zz1 lines in logfile and run taking a very long time
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#95 ·

  • obsolete finite function
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

    DReichLab/EIG#92 ·

  • XOR in snpsortit() of mcio.c
    Aperta

    Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 48/100

    DReichLab/EIG#91 ·

  • bad chrom: 100
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#88 · 2 commenti ·

  • Smartpca memory error
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    DReichLab/EIG#87 · 2 commenti ·

  • Issue when converting from plink to eigenstrat using convertf
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#86 · 4 commenti ·

  • .snp file format
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 30/100

    DReichLab/EIG#84 · 1 commento ·

  • smartpca eigen vector file missing individuals
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#83 · 3 commenti ·

  • Error while working with Eigensoft command smartpca command
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#81 · 1 commento ·

  • Unable to make bed *and* map for convertf
    Aperta

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#80 · 1 reazione ·

  • Segmentation fault with 1000G but not with HM3
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#76 · 2 commenti ·

  • Error with smarteigenstrat.perl accepting pca output from smartpca.perl
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#75 · 4 commenti ·

  • (getpedgenos) bad geno <DEL>
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#74 · 1 commento ·

  • Illegal instruction
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100

    DReichLab/EIG#72 · 4 commenti ·

  • maxpop 1000
    Aperta

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#71 · 1 commento ·

  • conda - smartpca stalling issue
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#70 · 5 commenti ·

  • Eigenstrat for 3 subpopulations
    Aperta

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    DReichLab/EIG#66 · 4 commenti ·

  • Unable to "make install"
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#65 · 1 commento ·

  • Converted *.ancestrymapgeno still a binary file
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#61 · 5 commenti ·

  • Compiled programs no longer in bin
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

    DReichLab/EIG#58 · 3 commenti ·

  • question about smarpca .perl -b parameter
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#51 · 3 commenti ·

  • Question: are there significant downsides to increasing IDSIZE?
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#49 ·

  • .snp error in Admixtools
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#47 · 2 commenti ·

  • sh: smartpca: command not found
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#46 · 6 commenti ·

  • Smartrel does not yield any output
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100

    DReichLab/EIG#44 ·

  • Question about an error using smartpca
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#43 · 2 commenti ·

  • smartpca: columns of SNP weight matrix are not orthogonal with ldregress on
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#42 · 6 commenti ·

  • XTX has zero trace
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#41 · 5 commenti ·

  • population label characters cut off displayed in the log file
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#38 ·

  • OOPS -i flag not specified at /usr/local/analysis/eigensoft/5.0.1/bin/smartpca.perl line 21.
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#35 · 3 commenti ·

  • .snp output format
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#33 · 8 commenti ·

  • smartpca output description
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#31 · 1 reazione ·

  • shrinkage correction documentation
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#30 · 2 commenti ·

  • fsthiprecision still giving 3 decimal places
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#29 · 2 commenti ·

  • ksrc/kjg_gsl.c:10:21: fatal error: lapacke.h: No such file or directory
    Aperta

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    DReichLab/EIG#27 · 2 commenti ·

  • ID too long
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#26 · 5 commenti ·

  • Decimal places in EigenStrat p-values?
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#24 ·

  • please explain
    Aperta

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    DReichLab/EIG#23 · 5 commenti ·

  • pca selection statistic
    Aperta

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    DReichLab/EIG#21 · 2 commenti ·

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