smartpca output description
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- c
- Ambito
- documentation
Direzione di ricerca
La issue identifica le sezioni dell’output di smartpca, ma non indica alcun file sorgente, test o punto di ingresso da esaminare. Inizia individuando il codice o la documentazione esistente che produce questi messaggi, quindi documenta il significato di ogni campo e riga di stato elencati con contesto sufficiente per interpretare l’output di esempio.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
I'm trying to get as much useful information as I can. But I find that there is rare information about the output of smartpca.
Could you please explain these sectors?
1.
kurtosis snps indivs
eigenvector 1 19.748 8.548
eigenvector 2 10.372 1.793
eigenvector 3 11.369 2.928
eigenvector 4 14.368 5.535
eigenvector 5 14.923 5.712
eigenvector 6 11.614 2.647
eigbestsnp 1 NW_005392842.1_342309 1 3475 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392842.1_1092099 1 3629 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392842.1_1092105 1 3630 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392858.1_844626 1 7110 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392858.1_917105 1 7157 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392858.1_1019387 1 7194 7.095
eigbestsnp 1 NW_005392872.1_2150841 1 9626 7.095
total number of snps killed in pass: 504962 used: 199335
number of samples used: 15 number of snps used: 704297
nodata: NW_005404811.1_267
nodata: NW_005404830.1_2218
- Lingua principale
- C
- Stelle
- 207
- Fork
- 61
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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