Update partial charge description in notebooks after implementing new validation
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Bewertung
- Schwierigkeit
- 1/5
- Geschätzter Aufwand
- Unter einer Stunde
- Anfängerfreundlichkeit
- 75/100
- Issue-Typ
- Dokumentation
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Aktivitätsstatus
- Aktiv
- Tech-Stack
- jupyter-notebook
- Bereich
- documentation
Rechercherichtung
Finde das ABFE-Tutorial und die zitierte Erklärung zu Partial Charges; durchsuche dann die anderen Notebooks nach derselben Erklärung. Passe die Formulierung so an, dass sie besagt, dass nichtdeterministische Methoden für Partial Charges zur Laufzeit nicht unterstützt werden, und prüfe, ob der überarbeitete Text in den betroffenen Notebooks einheitlich ist.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in
Currently, e.g. in ABFE tutorial:
If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.
After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".
- Vorherrschende Sprache
- Jupyter Notebook
- Sterne
- 70
- Forks
- 15
- Ø Merge
- 5 T. 19 Std.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 14
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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