Update partial charge description in notebooks after implementing new validation

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評估

難度
1/5
預估耗時
1 小時以內
新手友好度
75/100
Issue 類型
文件
描述清晰度
基本清楚
活躍度
活躍
技術堆疊
jupyter-notebook
領域
documentation

研究方向

找到 ABFE 教學文件並定位引用的部分電荷說明;接著在其他筆記本中搜尋相同的說明。更新措辭,說明執行階段不支援非確定性的部分電荷方法,並檢查修改後的文字在受影響的筆記本中是否一致。

由索引模型根據 Issue 內容生成。

描述

Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in

Currently, e.g. in ABFE tutorial:

If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.

After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".

主要語言
Jupyter Notebook
星號
70
分支
15
平均合併
5 天 19 小時
30 天內合併 PR
14

環境準備

這個專案沒有提供開發容器、Dockerfile 或貢獻指南,環境需要你自己搭建:先看它的 README,通用步驟見我們的新手貢獻指南。

從這裡開始

  1. 先讀完整個 Issue,再讀專案的貢獻指南。
  2. 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
  3. Fork 儲存庫,在一個分支上完成修改。
  4. 送出 Pull Request,並在描述裡引用這個 Issue 編號。

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