Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
Bewertung
- Schwierigkeit
- 3/5
- Geschätzter Aufwand
- 1-2 Tage
- Anfängerfreundlichkeit
- 68/100
- Issue-Typ
- Dokumentation
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Aktivitätsstatus
- Ruhig
- Tech-Stack
- jupyter-notebook
- Bereich
- cli, documentation
Rechercherichtung
Vergleiche cinnabar_absolute.ipynb mit plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb. Beginne damit, die Abläufe beider Notebooks zu lesen und zu untersuchen, wie sie Ausgaben der openfe CLI verwenden. Führe sie zu einem allgemeinen Cinnabar-Plotting-Notebook mit getrennten RBFE- und ABFE-Abschnitten zusammen. Überprüfe anschließend, dass beide Ergebnistypen abgedeckt sind und das Notebook für die openfe-Dokumentation geeignet ist.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
- Vorherrschende Sprache
- Jupyter Notebook
- Sterne
- 70
- Forks
- 15
- Ø Merge
- 4 T. 2 Std.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 6
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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