Regenerate the results for the mixed protocol tutorial

Offen
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Bewertung

Schwierigkeit
3/5
Geschätzter Aufwand
1-2 Tage
Anfängerfreundlichkeit
48/100
Issue-Typ
Feature
Klarheit
Größtenteils klar
Aktivitätsstatus
Aktiv
Tech-Stack
jupyter-notebook
Bereich
documentation

Rechercherichtung

The results are in the example linked from PR #350; inspect that tutorial and its results files to identify the outdated data and how they are produced. Regenerate the results with newer openfe and alchemiscale versions, then update the example; verify the tutorial can extract names and phases from the regenerated data. The issue also suggests reducing the dataset size, but leaves that choice open.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Beschreibung

The example results files in https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/pull/350 are generated with older visions of openfe on alchemiscale making extracting the names and phases for the analysis is awkward.

We should generate them again with a new version of openfe and update the exaample. We could also consider reducing the size of the dataset to help with long-term maintainability.

Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
70
Forks
15
Ø Merge
5 T. 19 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
14

Entwicklungsumgebung

Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.

Erste Schritte

  1. Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
  4. Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

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