Update partial charge description in notebooks after implementing new validation
维护者通常 3 天内回复
还没有人认领这个 Issue。
评估
- 难度
- 1/5
- 预计耗时
- 1 小时以内
- 新手友好度
- 75/100
- Issue 类型
- 文档
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 活跃
- 技术栈
- jupyter-notebook
调研方向
找到 ABFE 教程并定位引用的部分电荷说明；然后在其他笔记本中搜索相同的说明。更新措辞，说明运行时不支持非确定性的部分电荷方法，并检查修改后的文本在受影响的笔记本中是否一致。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in
Currently, e.g. in ABFE tutorial:
If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.
After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 70
- 派生
- 15
- 平均合并
- 5 天 19 小时
- 30 天内合并 PR
- 14
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks 的其他 Issue
-
Set a PR template for submissions to this repository可能重新可做 @atravitz 于 47 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 68/100
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks#330 · 已指派 1 人 ·
维护者通常 3 天内回复
-
Move the charge molecule with the CLI from tutorials to How-to (notebook)可能已有人在做 @hannahbaumann 于 4 天前认领。 未关闭
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks#362 · 已指派 1 人 ·
维护者通常 3 天内回复
-
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks#355 ·
维护者通常 3 天内回复
-
Getting AshGC charges cookbook可能重新可做 @jthorton 于 51 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks#328 · 已指派 1 人 ·
维护者通常 3 天内回复
-
Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs可能已有人在做 @hannahbaumann 于 6 天前认领。 未关闭
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 68/100
OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks#313 · 已指派 1 人 ·
维护者通常 3 天内回复
查看 OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks 的全部 Issue
相似的 Issue
-
help wanted
难度 2/5 半天 新手友好度 72/100
-
bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 80/100
-
sync-en
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 76/100
维护者通常 1 天内回复
-
sync-en
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 68/100
维护者通常 1 天内回复
-
Перевод устарел
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
维护者通常 1 天内回复