Update partial charge description in notebooks after implementing new validation

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評価

難易度
1/5
見積もり時間
1時間未満
初心者へのやさしさ
75/100
issue の種類
ドキュメント
明瞭さ
おおむね明確
活発さ
活発
技術スタック
jupyter-notebook
領域
documentation

調査の方向性

ABFEチュートリアルを見つけ、部分電荷に関する引用された説明を特定します。次に、ほかのノートブックで同じ説明を検索します。非決定論的な部分電荷の手法は実行時にサポートされないことを示す表現に更新し、修正後の文章が対象のノートブック間で一貫していることを確認します。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

説明

Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in

Currently, e.g. in ABFE tutorial:

If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.

After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".

主要言語
Jupyter Notebook
スター
70
フォーク
15
平均マージ
5日 19時間
マージ済み PR（30日）
14

環境構築

このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

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