Update partial charge description in notebooks after implementing new validation

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Evaluación

Dificultad
1/5
Tiempo estimado
Menos de una hora
Aptitud para principiantes
75/100
Tipo de issue
Documentación
Claridad
Bastante claro
Estado de actividad
Activo
Stack tecnológico
jupyter-notebook

Línea de trabajo

Encuentra el tutorial de ABFE y localiza la explicación citada sobre cargas parciales; después, busca la misma explicación en los demás notebooks. Actualiza la redacción para indicar que los métodos no deterministas de cargas parciales no son compatibles en tiempo de ejecución y comprueba que el texto revisado sea coherente en los notebooks afectados.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Descripción

Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in

Currently, e.g. in ABFE tutorial:

If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.

After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".

Lenguaje dominante
Jupyter Notebook
Estrellas
70
Forks
15
Merge medio
5 d 19 h
PR fusionados (30 d)
14

Preparar el entorno

Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

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