Update partial charge description in notebooks after implementing new validation
Les mainteneurs répondent en général sous 3 jours
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Évaluation
- Difficulté
- 1/5
- Temps estimé
- Moins d'une heure
- Accessibilité débutants
- 75/100
- Type d'issue
- Documentation
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- Active
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- documentation
Piste de recherche
Trouvez le tutoriel ABFE et repérez l’explication citée sur les charges partielles ; recherchez ensuite la même explication dans les autres notebooks. Modifiez la formulation pour indiquer que les méthodes non déterministes de calcul des charges partielles ne sont pas prises en charge à l’exécution, puis vérifiez que le texte révisé est cohérent dans les notebooks concernés.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in
Currently, e.g. in ABFE tutorial:
If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.
After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".
- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 70
- Forks
- 15
- Merge moyen
- 5 j 19 h
- PR mergées (30 j)
- 14
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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