Update partial charge description in notebooks after implementing new validation
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Ninguém assumiu esta issue ainda.
Avaliação
- Dificuldade
- 1/5
- Tempo estimado
- Menos de uma hora
- Facilidade para iniciantes
- 75/100
- Tipo de issue
- Documentação
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Status de atividade
- Ativa
- Stack de tecnologia
- jupyter-notebook
- Domínio
- documentation
Direção de pesquisa
Encontre o tutorial de ABFE e localize a explicação citada sobre cargas parciais; depois, pesquise a mesma explicação nos outros notebooks. Atualize a redação para indicar que métodos não determinísticos de cargas parciais não são compatíveis em tempo de execução e verifique se o texto revisado está consistente nos notebooks afetados.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in
Currently, e.g. in ABFE tutorial:
If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.
After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".
- Linguagem predominante
- Jupyter Notebook
- Estrelas
- 70
- Forks
- 15
- Merge médio
- 5d 19h
- PRs com merge (30d)
- 14
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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