Update partial charge description in notebooks after implementing new validation
I maintainer di solito rispondono entro 3 giorni
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Valutazione
- Difficoltà
- 1/5
- Tempo stimato
- Meno di un'ora
- Idoneità per principianti
- 75/100
- Tipo di issue
- Documentazione
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Attiva
- Stack tecnologico
- jupyter-notebook
- Ambito
- documentation
Direzione di ricerca
Trova il tutorial ABFE e individua la spiegazione citata sulle cariche parziali; poi cerca la stessa spiegazione negli altri notebook. Aggiorna la formulazione per indicare che i metodi non deterministici per le cariche parziali non sono supportati in fase di esecuzione e verifica che il testo rivisto sia coerente nei notebook interessati.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Update explanation of partial charge assignment once we get the partial charge validation in
Currently, e.g. in ABFE tutorial:
If a ligand has no partial charges, they are generated separately for each simulation, which can, depending on the selected partial charge method, lead to different charges between repeats or between the legs of a calculation involving the same ligand.
After validation, reword all of this to "non-deterministic partial charge methods are not supported at runtime".
- Lingua principale
- Jupyter Notebook
- Stelle
- 70
- Fork
- 15
- Merge medio
- 5g 19h
- PR unite (30g)
- 14
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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