Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

nf-core/chipseq

Accedi per seguire Vedi su GitHub

ChIP-seq peak-calling, QC and differential analysis pipeline.

nf-core/chipseq è adatto ai principianti?

Abbiamo visto troppo poche pull request recenti di contributori esterni su nf-core/chipseq per dire quanto spesso vengono accettate. Al momento non è aperta nessuna issue adatta ai principianti; l'elenco qui sotto mostra le altre issue che abbiamo per questo repository.

Stelle
245
Fork
184
Issue aperte per principianti
0
Issue indicizzate
17
Merge medio
6m
PR unite (30g)
1
Lingua principale
Nextflow
Licenza
MIT
Ultimo push su GitHub
7/10/2026
Ultima indicizzazione
19/9/2026
Guida per i contributori
Codice di condotta
Label per principianti
Nessuna label per principianti indicizzata

Come contribuire a nf-core/chipseq

  1. Leggi prima la guida per contribuire: spiega come i maintainer vogliono che le modifiche siano proposte, testate e revisionate.
  2. Il progetto include un dev container: aprilo in Codespaces per avere un ambiente funzionante nel browser.
  3. Leggi il suo codice di condotta: vale per issue e pull request tanto quanto per la chat.
  4. Segui il repository per sapere quando si apre una nuova issue adatta ai principianti, oppure guarda le altre issue qui sotto.
Adatte ai principianti Tutto
Aperta Tutte

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • MACS3 is reporting that 100 paired reads are needed, even when single end data is used as input
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

    nf-core/chipseq#524 · 2 commenti ·

  • Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/chipseq#511 ·

  • Switch local/module GTF2BED to nf-core/module BEDOPS_GTF2BED
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

    nf-core/chipseq#494 ·

  • Clarify genome size error and update usage documentation
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/chipseq#478 ·

  • Port bedtools_genomecov from local to nf-core module
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement improve-behaviour

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

    nf-core/chipseq#469 ·

  • Add minimum_alignment_q_score parameter for MAPQ filtering (similar to nf-core/cutandrun)
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100

    nf-core/chipseq#463 · 2 reazioni ·

  • Enable the use of CSI bam index
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/chipseq#454 · 2 commenti ·

  • Output .bed file not found in the MACS2 folder
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/chipseq#448 · 1 commento ·

  • Adjust x-axis to start at 1 for custom phantompeakqualtools NSC plot
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/chipseq#441 ·

  • Add --only_step options
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/chipseq#337 · 1 reazione ·

  • Spike ins normalization
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/chipseq#321 · 13 commenti · 4 reazioni ·

  • Find test dataset where PRESEQ doesn't fail
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    nf-core/chipseq#276 · 2 commenti · 1 assegnatario ·

  • Output bigwigs with macs2 p-value signal for every base-pair
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement feature-request

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/chipseq#251 · 4 commenti ·

  • Merged biological replicates
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

    nf-core/chipseq#213 · 4 reazioni ·

  • Add IDR analysis
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement feature-request

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/chipseq#87 · 5 commenti ·

  • JSON schema: Chipseq
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?
    docs

    nf-core/chipseq#458 · 1 assegnatario ·

  • Get rid of checksamplesheet.py and switch to nf-schema
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/chipseq#403 ·

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.