Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

nf-core/chipseq

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ChIP-seq peak-calling, QC and differential analysis pipeline.

Ist nf-core/chipseq einsteigerfreundlich?

Wir haben zuletzt zu wenige Pull Requests von externen Beitragenden an nf-core/chipseq gesehen, um zu sagen, wie oft sie gemergt werden. Gerade ist kein einsteigerfreundliches Issue offen; die Liste unten zeigt die übrigen Issues, die wir von diesem Repository kennen.

Sterne
245
Forks
184
Offene Anfänger-Issues
0
Indexierte Issues
17
Ø Merge
6 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
1
Vorherrschende Sprache
Nextflow
Lizenz
MIT
Letzter GitHub-Push
07.10.2026
Zuletzt indexiert
19.9.2026
Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex
Anfänger-Labels
Keine Anfänger-Labels indexiert

So tragen Sie zu nf-core/chipseq bei

  1. Lesen Sie zuerst den Contributing Guide: Er beschreibt, wie die Maintainer Änderungen vorgeschlagen, getestet und geprüft haben möchten.
  2. Das Projekt bringt einen Dev Container mit: Öffnen Sie es in Codespaces, und Sie haben eine lauffähige Umgebung im Browser.
  3. Lesen Sie den Verhaltenskodex: Er gilt für Issues und Pull Requests ebenso wie für den Chat.
  4. Folgen Sie dem Repository, um von neuen einsteigerfreundlichen Issues zu erfahren, oder sehen Sie sich die übrigen Issues unten an.
Einsteigerfreundlich Alles
Offen Alle

Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen

  • MACS3 is reporting that 100 paired reads are needed, even when single end data is used as input
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    nf-core/chipseq#524 · 2 Kommentare ·

  • Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/chipseq#511 ·

  • Switch local/module GTF2BED to nf-core/module BEDOPS_GTF2BED
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    nf-core/chipseq#494 ·

  • Clarify genome size error and update usage documentation
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    nf-core/chipseq#478 ·

  • Port bedtools_genomecov from local to nf-core module
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement improve-behaviour

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 38/100

    nf-core/chipseq#469 ·

  • Add minimum_alignment_q_score parameter for MAPQ filtering (similar to nf-core/cutandrun)
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    nf-core/chipseq#463 · 2 Reaktionen ·

  • Enable the use of CSI bam index
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    nf-core/chipseq#454 · 2 Kommentare ·

  • Output .bed file not found in the MACS2 folder
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    nf-core/chipseq#448 · 1 Kommentar ·

  • Adjust x-axis to start at 1 for custom phantompeakqualtools NSC plot
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    nf-core/chipseq#441 ·

  • Add --only_step options
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/chipseq#337 · 1 Reaktion ·

  • Spike ins normalization
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 20/100

    nf-core/chipseq#321 · 13 Kommentare · 4 Reaktionen ·

  • Find test dataset where PRESEQ doesn't fail
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    nf-core/chipseq#276 · 2 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • Output bigwigs with macs2 p-value signal for every base-pair
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement feature-request

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    nf-core/chipseq#251 · 4 Kommentare ·

  • Merged biological replicates
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

    nf-core/chipseq#213 · 4 Reaktionen ·

  • Add IDR analysis
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement feature-request

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    nf-core/chipseq#87 · 5 Kommentare ·

  • JSON schema: Chipseq
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    docs

    nf-core/chipseq#458 · 1 zugewiesene Person ·

  • Get rid of checksamplesheet.py and switch to nf-schema
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 25/100

    nf-core/chipseq#403 ·

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