Hacktoberfest 2026: as issues que os mantenedores marcaram para outubro, abertas e boas para iniciantes. Ver issues do Hacktoberfest

nf-core/chipseq

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ChIP-seq peak-calling, QC and differential analysis pipeline.

nf-core/chipseq é bom para iniciantes?

Vimos poucos pull requests recentes de contribuidores externos em nf-core/chipseq para dizer com que frequência eles recebem merge. No momento não há nenhuma issue para iniciantes aberta; a lista abaixo mostra as outras issues que temos deste repositório.

Estrelas
245
Forks
184
Issues abertas para iniciantes
0
Issues indexadas
17
Merge médio
6min
PRs com merge (30d)
1
Linguagem predominante
Nextflow
Licença
MIT
Último push no GitHub
7/10/2026
Última indexação
19/9/2026
Guia de contribuição
Código de conduta
Labels para iniciantes
Nenhum label para iniciantes indexado

Como contribuir com nf-core/chipseq

  1. Leia primeiro o guia de contribuição: ele explica como os mantenedores querem que as mudanças sejam propostas, testadas e revisadas.
  2. O projeto tem um dev container: abra no Codespaces para ter um ambiente funcionando no navegador.
  3. Leia o código de conduta: ele vale para issues e pull requests tanto quanto para o chat.
  4. Siga o repositório para saber quando uma nova issue para iniciantes for aberta, ou veja as outras issues abaixo.
Para iniciantes Tudo
Abertas Todas

Issues em que talvez alguém já esteja trabalhando aparecem no fim. Ordenar tudo por data

  • MACS3 is reporting that 100 paired reads are needed, even when single end data is used as input
    Aberta
    • Algo errado?
    bug

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    nf-core/chipseq#524 · 2 comentários ·

  • Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    nf-core/chipseq#511 ·

  • Switch local/module GTF2BED to nf-core/module BEDOPS_GTF2BED
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    nf-core/chipseq#494 ·

  • Clarify genome size error and update usage documentation
    Aberta
    • Algo errado?
    bug

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    nf-core/chipseq#478 ·

  • Port bedtools_genomecov from local to nf-core module
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement improve-behaviour

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 38/100

    nf-core/chipseq#469 ·

  • Add minimum_alignment_q_score parameter for MAPQ filtering (similar to nf-core/cutandrun)
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 42/100

    nf-core/chipseq#463 · 2 reações ·

  • Enable the use of CSI bam index
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    nf-core/chipseq#454 · 2 comentários ·

  • Output .bed file not found in the MACS2 folder
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    nf-core/chipseq#448 · 1 comentário ·

  • Adjust x-axis to start at 1 for custom phantompeakqualtools NSC plot
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    nf-core/chipseq#441 ·

  • Add --only_step options
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    nf-core/chipseq#337 · 1 reação ·

  • Spike ins normalization
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

    nf-core/chipseq#321 · 13 comentários · 4 reações ·

  • Find test dataset where PRESEQ doesn't fail
    Talvez livre de novo Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    nf-core/chipseq#276 · 2 comentários · 1 responsável ·

  • Output bigwigs with macs2 p-value signal for every base-pair
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement feature-request

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    nf-core/chipseq#251 · 4 comentários ·

  • Merged biological replicates
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 30/100

    nf-core/chipseq#213 · 4 reações ·

  • Add IDR analysis
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement feature-request

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    nf-core/chipseq#87 · 5 comentários ·

  • JSON schema: Chipseq
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?
    docs

    nf-core/chipseq#458 · 1 responsável ·

  • Get rid of checksamplesheet.py and switch to nf-schema
    Talvez já em andamento Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    nf-core/chipseq#403 ·

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