Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Refactoring
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Tranquilla
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia esaminando i subworkflow fastq_align_{aligner} e fastq_align_dna, quindi leggi la issue #11075 di nf-core/modules indicata. Determina come aggiungere chromap e risolvi la questione di progettazione ancora aperta relativa a star. Il lavoro è completato quando il piano di migrazione e le modifiche risultanti ai subworkflow sono concordati e implementati.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Potentially we should switch from the individual fastq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna.
For reference see here: https://github.com/nf-core/modules/issues/11075
Potential to dos:
- Adding
chromaptofastq_align_dna - How do we want to deal with
star, we would need to discuss that.
- Lingua principale
- Nextflow
- Stelle
- 245
- Fork
- 184
- Merge medio
- 6m
- PR unite (30g)
- 1
Preparare l'ambiente
Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Ha un modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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