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Enable the use of CSI bam index

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
bioinformatics

Direzione di ricerca

Leggi prima l’issue #327 e la pull request #328 collegati di nf-core/atacseq per comprendere il supporto previsto per gli indici CSI dei BAM. Individua quindi gli input e i passaggi di validazione corrispondenti del workflow chipseq; il lavoro è completato quando la pipeline accetta file BAM indicizzati con CSI e i controlli esistenti vengono completati correttamente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement
Description of feature

See https://github.com/nf-core/atacseq/issues/327 and https://github.com/nf-core/atacseq/pull/328

Lingua principale
Nextflow
Stelle
245
Fork
184
Merge medio
6m
PR unite (30g)
1

Preparare l'ambiente

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Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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