Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

nf-core/chipseq

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

ChIP-seq peak-calling, QC and differential analysis pipeline.

nf-core/chipseq có thân thiện với người mới không?

Gần đây có quá ít pull request của người đóng góp bên ngoài gửi tới nf-core/chipseq để nói chúng được merge thường xuyên đến đâu. Hiện chưa có issue nào phù hợp với người mới đang mở; danh sách bên dưới là các issue khác chúng tôi có của kho này.

Star
245
Fork
184
Issue cho người mới đang mở
0
Issue đã lập chỉ mục
17
Merge trung bình
6 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
1
Ngôn ngữ chính
Nextflow
Giấy phép
MIT
Lần push lên GitHub gần nhất
7/10/2026
Lập chỉ mục gần nhất
19/9/2026
Hướng dẫn đóng góp
Quy tắc ứng xử
Label cho người mới
Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới

Cách đóng góp cho nf-core/chipseq

  1. Hãy đọc hướng dẫn đóng góp trước: nó cho biết maintainer muốn thay đổi được đề xuất, kiểm thử và review ra sao.
  2. Dự án có sẵn dev container: mở trong Codespaces để có ngay môi trường chạy được trong trình duyệt.
  3. Hãy đọc quy tắc ứng xử: nó áp dụng cho issue và pull request cũng như trò chuyện.
  4. Theo dõi kho này để biết khi có issue mới phù hợp với người mới, hoặc xem các issue khác bên dưới.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • MACS3 is reporting that 100 paired reads are needed, even when single end data is used as input
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nf-core/chipseq#524 · 2 bình luận ·

  • Change simple fasq_align_{aligner} subworkflows to fastq_align_dna
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/chipseq#511 ·

  • Switch local/module GTF2BED to nf-core/module BEDOPS_GTF2BED
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    nf-core/chipseq#494 ·

  • Clarify genome size error and update usage documentation
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nf-core/chipseq#478 ·

  • Port bedtools_genomecov from local to nf-core module
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement improve-behaviour

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100

    nf-core/chipseq#469 ·

  • Add minimum_alignment_q_score parameter for MAPQ filtering (similar to nf-core/cutandrun)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    nf-core/chipseq#463 · 2 reaction ·

  • Enable the use of CSI bam index
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/chipseq#454 · 2 bình luận ·

  • Output .bed file not found in the MACS2 folder
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/chipseq#448 · 1 bình luận ·

  • Adjust x-axis to start at 1 for custom phantompeakqualtools NSC plot
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    nf-core/chipseq#441 ·

  • Add --only_step options
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/chipseq#337 · 1 reaction ·

  • Spike ins normalization
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100

    nf-core/chipseq#321 · 13 bình luận · 4 reaction ·

  • Find test dataset where PRESEQ doesn't fail
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    nf-core/chipseq#276 · 2 bình luận · 1 người được giao ·

  • Output bigwigs with macs2 p-value signal for every base-pair
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement feature-request

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    nf-core/chipseq#251 · 4 bình luận ·

  • Merged biological replicates
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    nf-core/chipseq#213 · 4 reaction ·

  • Add IDR analysis
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement feature-request

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/chipseq#87 · 5 bình luận ·

  • JSON schema: Chipseq
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    docs

    nf-core/chipseq#458 · 1 người được giao ·

  • Get rid of checksamplesheet.py and switch to nf-schema
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100

    nf-core/chipseq#403 ·

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.