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Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
68/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Tranquilla
Stack tecnologico
jupyter-notebook
Ambito
cli, documentation

Direzione di ricerca

Confronta cinnabar_absolute.ipynb con plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, iniziando col leggere i flussi di entrambi i notebook e il modo in cui utilizzano gli output della openfe CLI. Uniscili in un notebook generale per il plotting con Cinnabar, con sezioni distinte per RBFE e ABFE, quindi verifica che entrambi i tipi di risultato siano coperti e che il notebook sia adatto alla documentazione di openfe.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.

Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
70
Fork
15
Merge medio
10h 42m
PR unite (30g)
2

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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