Regenerate the results for the mixed protocol tutorial

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Évaluation

Difficulté
3/5
Temps estimé
1-2 jours
Accessibilité débutants
48/100
Type d'issue
Fonctionnalité
Clarté
Plutôt claire
Activité
Active
Stack technique
jupyter-notebook
Domaine
documentation

Piste de recherche

The results are in the example linked from PR #350; inspect that tutorial and its results files to identify the outdated data and how they are produced. Regenerate the results with newer openfe and alchemiscale versions, then update the example; verify the tutorial can extract names and phases from the regenerated data. The issue also suggests reducing the dataset size, but leaves that choice open.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

The example results files in https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/pull/350 are generated with older visions of openfe on alchemiscale making extracting the names and phases for the analysis is awkward.

We should generate them again with a new version of openfe and update the exaample. We could also consider reducing the size of the dataset to help with long-term maintainability.

Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
70
Forks
15
Merge moyen
5 j 19 h
PR mergées (30 j)
14

Préparer son environnement

Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

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