Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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Évaluation
- Difficulté
- 3/5
- Temps estimé
- 1-2 jours
- Accessibilité débutants
- 68/100
- Type d'issue
- Documentation
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- Calme
- Stack technique
- jupyter-notebook
- Domaine
- cli, documentation
Piste de recherche
Comparez cinnabar_absolute.ipynb avec plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, en commençant par lire le déroulement des deux notebooks et la manière dont ils utilisent les sorties de la openfe CLI. Combinez-les en un notebook général de visualisation avec Cinnabar, avec des sections distinctes pour RBFE et ABFE, puis vérifiez que les deux types de résultats sont couverts et que le notebook convient à la documentation openfe.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
- Langage dominant
- Jupyter Notebook
- Étoiles
- 70
- Forks
- 15
- Merge moyen
- 4 j 2 h
- PR mergées (30 j)
- 6
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
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- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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