Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

PEtab-dev/libpetab-python

Đăng nhập để theo dõi Xem trên GitHub

Python package for working with PEtab files

PEtab-dev/libpetab-python có thân thiện với người mới không?

Maintainer của PEtab-dev/libpetab-python thường phản hồi pull request trong vòng 1 ngày. Hiện có 4 issue phù hợp với người mới đang mở.

Star
18
Fork
9
Issue cho người mới đang mở
4
Issue đã lập chỉ mục
60
Merge trung bình
2 ngày 4 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
30
Ngôn ngữ chính
Python
Giấy phép
MIT
Lần push lên GitHub gần nhất
26/10/2026
Lập chỉ mục gần nhất
20/9/2026
Hướng dẫn đóng góp
Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới
Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới

Cách đóng góp cho PEtab-dev/libpetab-python

  1. Hãy đọc hướng dẫn đóng góp trước: nó cho biết maintainer muốn thay đổi được đề xuất, kiểm thử và review ra sao.
  2. Đóng góp của bạn sẽ được phát hành theo giấy phép MIT của dự án.
  3. Chọn một trong 4 issue phù hợp với người mới đang mở bên dưới và bình luận rằng bạn muốn làm nó trước khi bắt đầu.
Phù hợp cho người mới Tất cả
Đang mở Tất cả

Các issue có thể đã có người làm được xếp cuối danh sách. Sắp xếp tất cả theo ngày

  • `petab_files_1to2` keeps a stale model file when converting into a non-empty output directory
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 73/100

    PEtab-dev/libpetab-python#566 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2: Update parameter table validation for PEtab 2.0 erratum E1 (infinite bounds)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 55/100

    PEtab-dev/libpetab-python#565 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2: linter doesn't check that placeholder IDs are unique
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    PEtab-dev/libpetab-python#555 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • `sympify_petab` returns `Integer` for Python/numpy integers, but `Float` for numeric strings
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 50/100

    PEtab-dev/libpetab-python#553 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • `petab_math_str` writes `nan` and `zoo`, which are not valid PEtab
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#549 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2: writing a problem reformats all math expressions, including unchanged ones
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#548 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • `ExperimentsToSbmlConverter`: "no priority set" warning is unreachable
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#525 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • An estimated parameter is silently dropped from the simulation mapping when the model cannot give it a value
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100

    PEtab-dev/libpetab-python#522 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Condition-table override referencing a parameter with a non-numeric InitialAssignment crashes with an opaque KeyError
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#519 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Improve model abstractions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#518 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Mapping table contributions to parameter table validation (SciML use case)
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2 validation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#494 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Support for discrete noise distributions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#466 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add CLI for petab v1->v2 conversion
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#453 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add goodness-of-fit and residual plots to visualization examples
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#439 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • API for renaming PEtab entities
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#438 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Remove `v2.Problem.*_df`
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#409 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2: Visualization functions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#398 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Document release process
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    documentation

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#396 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2: Update validator
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2 validation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#369 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • antlr runtime version
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 42/100

    PEtab-dev/libpetab-python#344 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • `flatten_timepoint_specific_output_overrides` should not do anything if there are no timepoint-specific output parameters
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#314 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add functionality for computing posteriors
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#312 · 2 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Refactor priors
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    PEtab-dev/libpetab-python#311 · 2 reaction · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Feature to automate handling of replicate data
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?

    PEtab-dev/libpetab-python#310 · 1 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • PEtab Simulator update_parameters
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#305 · 2 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Replace individual dataframe arguments by Problem objects
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#301 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • v2 validation: atomize checks
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v2

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#289 · 1 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Integration of extensions
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#273 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • composite problem
    Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#265 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Wrong plot_goodness_of_fit if different order of rows in measurement_df and simulation_df
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    bug visualization

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#247 · 1 bình luận · 2 reaction ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 validation

    Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#217 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Validator: Add option to warn about unused / non-standard columns
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement v1 validation

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#128 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Python API for linter
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    enhancement v1

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#35 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • False positive invalid condition ID.
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1

    PEtab-dev/libpetab-python#366 · 6 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • single objectivePriorParameters are cast to numpy.float64
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#27 · 7 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • writer functions do not perform sanity checks + use misleading options for writing tsv
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#26 · 11 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Should unspecified optional strings be the empty string or NaN?
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question v1

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#25 · 4 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Visualization of measurements without condition table and visualization table
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#22 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Visualization: if column 'XValues' not provided and multiple conditions should be plotted automatically
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 visualization

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#21 · 2 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • consistent coloring of legend entries across plots
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 visualization

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#18 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • xOffset for logscale xValues
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    question v1 visualization

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#17 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • BarPlots ignore xValues
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#16 · 6 bình luận · 2 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Parallelize plotting for large amounts of subplots (saved to files)
    Có thể làm lại được Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#11 · 1 reaction · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Implement validation CompositeProblem
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1 validation

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#9 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add function to create joint parameter table from multiple models and measurement files
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    v1

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#5 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Add: Allow plotting by observableID & simCondID at the same time
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    visualization

    Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#4 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • add: plotting STD if the column noiseParameter has values and no replicates available
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    visualization

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#3 · 1 bình luận ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • add case in visualization routine: in measurementData file, if same simulationConditionId, but differing preequilibrationId etc.
    Đang mở
    • Có gì không ổn?
    visualization

    Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#2 ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • `ExperimentsToSbmlConverter`: assign a safe default event priority automatically where possible
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?

    Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#526 · 1 bình luận · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

  • Validator does not check for required column `noiseFormula` in observables table
    Có thể đã có người làm Đang mở
    • Có gì không ổn?
    validation

    PEtab-dev/libpetab-python#219 · 1 người được giao ·

    Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.