Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

PEtab-dev/libpetab-python

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Python package for working with PEtab files

Ist PEtab-dev/libpetab-python einsteigerfreundlich?

Die Maintainer von PEtab-dev/libpetab-python antworten auf einen Pull Request meist binnen 1 Tag. Derzeit sind 3 einsteigerfreundliche Issues offen.

Sterne
18
Forks
9
Offene Anfänger-Issues
3
Indexierte Issues
60
Ø Merge
2 T. 4 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
30
Vorherrschende Sprache
Python
Lizenz
MIT
Letzter GitHub-Push
26.10.2026
Zuletzt indexiert
20.9.2026
Beitragsleitfaden
Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels
Keine Anfänger-Labels indexiert

So tragen Sie zu PEtab-dev/libpetab-python bei

  1. Lesen Sie zuerst den Contributing Guide: Er beschreibt, wie die Maintainer Änderungen vorgeschlagen, getestet und geprüft haben möchten.
  2. Ihre Beiträge werden unter der MIT-Lizenz des Projekts veröffentlicht.
  3. Wählen Sie eines der 3 offenen einsteigerfreundlichen Issues unten und schreiben Sie vor dem Start einen Kommentar, dass Sie es übernehmen möchten.
Einsteigerfreundlich Alles
Offen Alle

Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen

  • `petab_files_1to2` keeps a stale model file when converting into a non-empty output directory
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 73/100

    PEtab-dev/libpetab-python#566 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2: Update parameter table validation for PEtab 2.0 erratum E1 (infinite bounds)
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    PEtab-dev/libpetab-python#565 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2: linter doesn't check that placeholder IDs are unique
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    PEtab-dev/libpetab-python#555 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • `sympify_petab` returns `Integer` for Python/numpy integers, but `Float` for numeric strings
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 50/100

    PEtab-dev/libpetab-python#553 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • `petab_math_str` writes `nan` and `zoo`, which are not valid PEtab
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#549 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2: writing a problem reformats all math expressions, including unchanged ones
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#548 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • `ExperimentsToSbmlConverter`: "no priority set" warning is unreachable
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#525 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • An estimated parameter is silently dropped from the simulation mapping when the model cannot give it a value
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 48/100

    PEtab-dev/libpetab-python#522 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Condition-table override referencing a parameter with a non-numeric InitialAssignment crashes with an opaque KeyError
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 72/100

    PEtab-dev/libpetab-python#519 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Improve model abstractions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#518 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Mapping table contributions to parameter table validation (SciML use case)
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2 validation

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#494 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Support for discrete noise distributions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#466 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add CLI for petab v1->v2 conversion
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#453 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add goodness-of-fit and residual plots to visualization examples
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    documentation

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#439 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • API for renaming PEtab entities
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#438 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Remove `v2.Problem.*_df`
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#409 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2: Visualization functions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#398 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Document release process
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    documentation

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#396 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2: Update validator
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2 validation

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#369 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • antlr runtime version
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 42/100

    PEtab-dev/libpetab-python#344 · 4 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • `flatten_timepoint_specific_output_overrides` should not do anything if there are no timepoint-specific output parameters
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#314 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add functionality for computing posteriors
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#312 · 2 Reaktionen ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Refactor priors
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    PEtab-dev/libpetab-python#311 · 2 Reaktionen · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Feature to automate handling of replicate data
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    PEtab-dev/libpetab-python#310 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • PEtab Simulator update_parameters
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#305 · 2 Reaktionen ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Replace individual dataframe arguments by Problem objects
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#301 · 1 Reaktion ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • v2 validation: atomize checks
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v2

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#289 · 1 Reaktion ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Integration of extensions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#273 · 2 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • composite problem
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#265 · 4 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Wrong plot_goodness_of_fit if different order of rows in measurement_df and simulation_df
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug visualization

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#247 · 1 Kommentar · 2 Reaktionen ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 validation

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#217 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Validator: Add option to warn about unused / non-standard columns
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement v1 validation

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#128 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Python API for linter
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement v1

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#35 · 2 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • False positive invalid condition ID.
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1

    PEtab-dev/libpetab-python#366 · 6 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • single objectivePriorParameters are cast to numpy.float64
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#27 · 7 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • writer functions do not perform sanity checks + use misleading options for writing tsv
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#26 · 11 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Should unspecified optional strings be the empty string or NaN?
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    question v1

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#25 · 4 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Visualization of measurements without condition table and visualization table
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#22 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Visualization: if column 'XValues' not provided and multiple conditions should be plotted automatically
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 visualization

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#21 · 2 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • consistent coloring of legend entries across plots
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 visualization

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    PEtab-dev/libpetab-python#18 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • xOffset for logscale xValues
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    question v1 visualization

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#17 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • BarPlots ignore xValues
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#16 · 6 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Parallelize plotting for large amounts of subplots (saved to files)
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 visualization

    PEtab-dev/libpetab-python#11 · 1 Reaktion · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Implement validation CompositeProblem
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1 validation

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#9 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add function to create joint parameter table from multiple models and measurement files
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    v1

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    PEtab-dev/libpetab-python#5 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Add: Allow plotting by observableID & simCondID at the same time
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    visualization

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#4 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • add: plotting STD if the column noiseParameter has values and no replicates available
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    visualization

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#3 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • add case in visualization routine: in measurementData file, if same simulationConditionId, but differing preequilibrationId etc.
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    visualization

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    PEtab-dev/libpetab-python#2 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • `ExperimentsToSbmlConverter`: assign a safe default event priority automatically where possible
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    PEtab-dev/libpetab-python#526 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Validator does not check for required column `noiseFormula` in observables table
    Evtl. vergeben Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    validation

    PEtab-dev/libpetab-python#219 · 1 zugewiesene Person ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

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