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sanger-tol/sequencecomposition

Nextflow DSL2 pipeline to extract statistics from a genome about its sequence composition

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Última indexação
14 de ago. de 2026
Último push no GitHub
28 de mai. de 2026
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Nextflow
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help wantedgood first issue

Issues

16 issues indexadas abertas

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Gap coordinates report
enhancementgood first issueuser request
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sanger-tol / sequencecomposition · #54 · 4 de jun. de 2026 · Nextflow · 2 estrelas

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Centromer finder
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #45 · 19 de fev. de 2026 · Nextflow · 2 estrelas

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ModDotPlot
good first issuehelp wanteduser request
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sanger-tol / sequencecomposition · #28 · 17 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Stop codon frequency track
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #26 · 17 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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DFAM
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #25 · 17 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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LTR retrotransposons from `LTRdigest`
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #24 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Inverted repeats from `einverted`
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #23 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Telomere finder (Max Brown)
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #22 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Red
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #19 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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LTR retrotransposons from `LTRharvest`
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #18 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Tandem repeats from `trf`
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #17 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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Dustmasker
good first issuehelp wanted
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sanger-tol / sequencecomposition · #16 · 2 de jun. de 2024 · Nextflow · 2 estrelas

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stainedglass self-alignment heatmap
help wanteduser request
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sanger-tol / sequencecomposition · #14 · 28 de nov. de 2023 · Nextflow · 2 estrelas

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Genome mappability
help wantedquestion
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sanger-tol / sequencecomposition · #30 · 2 de mai. de 2022 · Nextflow · 2 estrelas

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Transcript mappability
help wantedquestion
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sanger-tol / sequencecomposition · #31 · 2 de mai. de 2022 · Nextflow · 2 estrelas

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