sanger-tol/sequencecomposition

DFAM

Aberta

#25 aberto em 17 de jun. de 2024

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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Essentially, this is running hmmscan across the entire genome.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Revise o pipeline GDA para entender como o hmmscan é implementado e integre a funcionalidade equivalente a este pipeline Nextflow.
Pilha de tecnologia
None
Domain
data engineering
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
Meio dia
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
GitNextflow
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
50