sanger-tol/sequencecomposition

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Aberta

#31 aberto em 2 de mai. de 2022

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Description

Description of feature

This is ideally done with RNA-seq data. It is equal to percentage of reads mapped to the genome. Possible software: WGSIM

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Revise a estrutura do pipeline Nextflow e as definições de processos existentes. Investigue como usar o WGSIM para simular leituras e calcular a porcentagem de leituras mapeadas no genoma.
Pilha de tecnologia
groovy
Domain
data
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
Meio dia
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
GitNextflow
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
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