sanger-tol/sequencecomposition

Tandem repeats from `trf`

Aberta

#17 aberto em 2 de jun. de 2024

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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline. Software available at https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Inspecione o código fonte do pipeline GDA para entender como o TRF é usado para detecção de repetições em tandem, localize a estrutura de processos correspondente neste repositório para adicionar uma etapa semelhante. Verifique se o TRF já está incluído em um contêiner ou se precisa ser adicionado.
Pilha de tecnologia
shell
Domain
dataanalytics
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
1-2 dias
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Ativo
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
GitNextflow
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
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