sanger-tol/sequencecomposition

LTR retrotransposons from `LTRdigest`

Aberta

#24 aberto em 2 de jun. de 2024

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Description

Copy the functionality from the GDA pipeline.

Guia do colaborador

Direção de pesquisa
Inspecione o pipeline GDA para ver como ele usa LTRdigest para retrotransposons LTR e, em seguida, examine os módulos existentes neste pipeline para planejar a integração.
Pilha de tecnologia
None
Domain
data
Tipo Issue
Funcionalidade
DifficultyDificuldade de implementação estimada para um novo contribuidor, de 1 para alterações muito pequenas a 5 para trabalho de nível especializado.
3
Tempo estimadoUm intervalo de tempo aproximado para um colaborador experiente investigar, implementar, testar e preparar um pull request.
Meio dia
Status da atividadeQuão disponível o issue aparece agora: novo, ativo, obsoleto, bloqueado ou aguardando entrada do mantenedor.
Recente
ClarityCom que clareza o issue explica a mudança esperada, os critérios de aceitação e a próxima etapa.
Principalmente claro
Prerequisites
GitNextflow
Simpatia para novatosUma pontuação de 1 a 100 que estima o quão acessível este issue é para colaboradores iniciantes.
70