Merge cinnabar-absolute and cinnabar RBFE plotting docs
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Avaliação
- Dificuldade
- 3/5
- Tempo estimado
- 1-2 dias
- Facilidade para iniciantes
- 68/100
- Tipo de issue
- Documentação
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Status de atividade
- Pouca atividade
- Stack de tecnologia
- jupyter-notebook
- Domínio
- cli, documentation
Direção de pesquisa
Compare cinnabar_absolute.ipynb com plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb, começando pela leitura dos fluxos de ambos os notebooks e de como eles consomem as saídas da openfe CLI. Combine-os em um notebook geral de plotagem com Cinnabar, com seções distintas para RBFE e ABFE, e depois verifique se ambos os tipos de resultado estão cobertos e se o notebook é adequado para a documentação do openfe.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/cookbook/cinnabar_absolute.ipynb is currently not used in the openfe docs, we should merge it into https://github.com/OpenFreeEnergy/ExampleNotebooks/blob/main/plotting_rbfes_with_cinnabar/PlottingFreeEnergiesUsingCinnabar.ipynb to make a general plotting with cinnabar notebook with sections for RBFE and ABFE result plotting starting from outputs from the openfe CLI.
- Linguagem predominante
- Jupyter Notebook
- Estrelas
- 70
- Forks
- 15
- Merge médio
- 1d 4h
- PRs com merge (30d)
- 7
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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