Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

nf-core/variantbenchmarking

Accedi per seguire Vedi su GitHub

Pipeline to evaluate and validate the accuracy of variant calling methods in genomic research

nf-core/variantbenchmarking è adatto ai principianti?

Negli ultimi 30 giorni nf-core/variantbenchmarking ha accettato 8 delle 11 pull request di contributori esterni, e i suoi maintainer di solito rispondono entro 1 giorno. Al momento non è aperta nessuna issue adatta ai principianti; l'elenco qui sotto mostra le altre issue che abbiamo per questo repository.

Stelle
52
Fork
33
Issue aperte per principianti
0
Issue indicizzate
37
Merge medio
19h 47m
PR unite (30g)
15
Lingua principale
Nextflow
Licenza
MIT
Ultimo push su GitHub
7/10/2026
Ultima indicizzazione
19/9/2026
Guida per i contributori
Codice di condotta
Label per principianti
good first issue

Come contribuire a nf-core/variantbenchmarking

  1. Leggi prima la guida per contribuire: spiega come i maintainer vogliono che le modifiche siano proposte, testate e revisionate.
  2. Il progetto include un dev container: aprilo in Codespaces per avere un ambiente funzionante nel browser.
  3. Leggi il suo codice di condotta: vale per issue e pull request tanto quanto per la chat.
  4. Segui il repository per sapere quando si apre una nuova issue adatta ai principianti, oppure guarda le altre issue qui sotto.
Adatte ai principianti Tutto
Aperta Tutte

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • Pipeline level snapshots
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement low priority

    Difficoltà 3/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#350 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • hap.py benchmarking silently produces empty results for GRCh37/b37 (non-chr-prefixed) references
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 68/100

    nf-core/variantbenchmarking#324 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Running analysis on sample sample id's
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 48/100

    nf-core/variantbenchmarking#307 · 3 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • vcf_variant_filtering
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#293 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • wittyer_benchmark
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#291 · 2 assegnatari ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • svanalyser_benchmark
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#285 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • happy_benchmark
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#284 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Port local subworkflows to nf-core/modules
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement good first issue low priority

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#265 · 2 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Port local modules to nf-core/modules
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement low priority

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#264 · 5 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add TP_comp for sompy
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#233 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • unexpected F1 score running somatic snv/indel variants benchmarking
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#225 · 10 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Multiple truth sets within the same run
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement not urgent

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#202 · 3 commenti · 2 reazioni ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add vcfdist tool for benchmarking
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement good first issue

    nf-core/variantbenchmarking#199 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • SEQC2 test fails for rtgtools as malformatted INFO field in the truth
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#186 · 1 commento ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • igv-reports
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    backlog enhancement low priority

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#184 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add total stats for happy merging snps and indels
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    backlog enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#183 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • vt decompose_blocksub
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement good first issue

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#114 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • generate somatic test files for COLO-829
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    backlog enhancement not urgent

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    nf-core/variantbenchmarking#93 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • oncoliner assessment tool
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement not urgent

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

    nf-core/variantbenchmarking#92 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • add oncoliner tools
    Forse di nuovo libera Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement not urgent

    nf-core/variantbenchmarking#89 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • support for trio analysis for mendelian inheritance errors
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    backlog enhancement

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#82 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • coverage stratification
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    backlog enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#65 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • some of test configs under conf/ are outdated
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?
    bug

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#321 · 2 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • Label change for process VCF_TO_CSV
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

    nf-core/variantbenchmarking#306 · 5 commenti ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • vcf_to_csv -> gatk4/variantstotable
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement low priority

    nf-core/variantbenchmarking#280 · 1 assegnatario ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • improve plots/statistics
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#180 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

  • somatic workflow
    Forse già presa Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    nf-core/variantbenchmarking#96 ·

    I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.