Running analysis on sample sample id's

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
48/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Tranquilla

Direzione di ricerca

Inizia tracciando il percorso dell’analisi a coppie del workflow e il modo in cui attualmente convalida gli ID dei campioni. Verifica se è possibile rappresentare due input con lo stesso ID ma con output di caller diversi senza compromettere i confronti esistenti. Il lavoro è completato quando i campioni con lo stesso ID vengono accettati e i risultati a coppie rimangono corretti; l’issue non indica file o test, quindi questi punti di ingresso devono essere individuati per primi.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Would it be possible to run pairwise analysis on same id samples only ?
At present the workflow accepts test1, test2, but, let's say you have same id H021-YAGAH and H021-YAGAH, but output from different callers. would it be possible to run?

Lingua principale
Nextflow
Stelle
53
Fork
34
Merge medio
1g 5h
PR unite (30g)
20

Preparare l'ambiente

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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