vcf_to_csv -> gatk4/variantstotable

Aperta
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@Gab-23 ci sta già lavorando.

Dal 10/3/2026.

  • #294 di @Gab-23 — aperta

Valutazione

Questa issue non è ancora stata valutata.

Descrizione

enhancement low priority
Description of feature

I am not sure if this is something possible but worth to try.

Check if https://github.com/nf-core/variantbenchmarking/blob/dev/modules/local/custom/vcf_to_csv/main.nf can be replaced with gatk4/variantstotable (nf-core module)

  • check if all the subworkflows works as expected with the new module.
Lingua principale
Nextflow
Stelle
54
Fork
36
Merge medio
21h 20m
PR unite (30g)
20

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