Hacktoberfest 2026: los issues que los mantenedores marcaron para octubre, abiertos y aptos para principiantes. Explorar issues de Hacktoberfest

nf-core/variantbenchmarking

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Pipeline to evaluate and validate the accuracy of variant calling methods in genomic research

¿Es nf-core/variantbenchmarking apto para principiantes?

En los últimos 30 días, nf-core/variantbenchmarking fusionó 8 de 11 pull requests de colaboradores externos, y sus mantenedores suelen responder en 1 día. Ahora mismo no hay ningún issue apto para principiantes abierto; la lista de abajo muestra los demás issues que tenemos de este repositorio.

Estrellas
52
Forks
33
Issues abiertos para principiantes
0
Issues indexados
37
Merge medio
19 h 47 min
PR fusionados (30 d)
15
Lenguaje dominante
Nextflow
Licencia
MIT
Último push a GitHub
7/10/2026
Última indexación
19/9/2026
Guía de contribución
Código de conducta
Etiquetas para principiantes
good first issue

Cómo contribuir a nf-core/variantbenchmarking

  1. Lee primero la guía de contribución: explica cómo quieren los mantenedores que se propongan, prueben y revisen los cambios.
  2. El proyecto incluye un dev container: ábrelo en Codespaces para tener un entorno que funciona en tu navegador.
  3. Lee su código de conducta: se aplica a los issues y pull requests igual que al chat.
  4. Sigue el repositorio para enterarte cuando se abra un nuevo issue apto para principiantes, o revisa los demás issues de abajo.
Para principiantes Todo
Abierto Todos

Las issues en las que quizá ya trabaja alguien aparecen al final. Ordenar todo por fecha

  • Pipeline level snapshots
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement low priority

    Dificultad 3/5 Medio día Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#350 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • hap.py benchmarking silently produces empty results for GRCh37/b37 (non-chr-prefixed) references
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 68/100

    nf-core/variantbenchmarking#324 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Running analysis on sample sample id's
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 48/100

    nf-core/variantbenchmarking#307 · 3 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • vcf_variant_filtering
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#293 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • wittyer_benchmark
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#291 · 2 asignados ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • svanalyser_benchmark
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#285 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • happy_benchmark
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    low priority

    nf-core/variantbenchmarking#284 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Port local subworkflows to nf-core/modules
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement good first issue low priority

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#265 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Port local modules to nf-core/modules
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement low priority

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#264 · 5 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add TP_comp for sompy
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#233 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • unexpected F1 score running somatic snv/indel variants benchmarking
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#225 · 10 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Multiple truth sets within the same run
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement not urgent

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#202 · 3 comentarios · 2 reacciones ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add vcfdist tool for benchmarking
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement good first issue

    nf-core/variantbenchmarking#199 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • SEQC2 test fails for rtgtools as malformatted INFO field in the truth
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#186 · 1 comentario ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • igv-reports
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    backlog enhancement low priority

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#184 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add total stats for happy merging snps and indels
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    backlog enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#183 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • vt decompose_blocksub
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement good first issue

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#114 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • generate somatic test files for COLO-829
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    backlog enhancement not urgent

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

    nf-core/variantbenchmarking#93 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • oncoliner assessment tool
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement not urgent

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

    nf-core/variantbenchmarking#92 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • add oncoliner tools
    Quizá libre de nuevo Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement not urgent

    nf-core/variantbenchmarking#89 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • support for trio analysis for mendelian inheritance errors
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    backlog enhancement

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#82 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • coverage stratification
    Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    backlog enhancement

    Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

    nf-core/variantbenchmarking#65 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • some of test configs under conf/ are outdated
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    bug

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

    nf-core/variantbenchmarking#321 · 2 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • Label change for process VCF_TO_CSV
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement

    Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 48/100

    nf-core/variantbenchmarking#306 · 5 comentarios ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • vcf_to_csv -> gatk4/variantstotable
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?
    enhancement low priority

    nf-core/variantbenchmarking#280 · 1 asignado ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • improve plots/statistics
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

    nf-core/variantbenchmarking#180 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

  • somatic workflow
    Posiblemente ocupada Abierto
    • ¿Algo no está bien?

    Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

    nf-core/variantbenchmarking#96 ·

    Los mantenedores suelen responder en 1 día

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