Port local subworkflows to nf-core/modules

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Dal 11/3/2026.

Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Ambito
bioinformatics

Direzione di ricerca

Inizia individuando i sei subworkflow locali indicati nell’issue: happy_benchmark, small_germline_benchmark, small_somatic_benchmark, sompy_benchmark, sv_germline_benchmark e svanalyser_benchmark. Leggi prima le loro definizioni attuali e le convenzioni di nf-core/modules. Il lavoro è completato quando ogni subworkflow elencato è stato portato e i controlli pertinenti della pipeline confermano che i workflow di benchmark continuano a essere eseguiti.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

enhancement good first issue low priority
Description of feature
  • happy_benchmark
  • small_germline_benchmark
  • small_somatic_benchmark
  • sompy_benchmark
  • sv_germline_benchmark
  • svanalyser_benchmark
Lingua principale
Nextflow
Stelle
53
Fork
34
Merge medio
1g 5h
PR unite (30g)
20

Preparare l'ambiente

Apri in Codespaces

Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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