add oncoliner tools
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
@kubranarci ci sta già lavorando.
Dal 14/10/2024.
Valutazione
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Descrizione
Description of feature
ONCOLINER project as a part of EUCANCan has main 3 tools for harmonisation, assessment and improvement of somatic variant callers. All the tools can be used one another or standalone. I am thinking about adding harmonization (which is variant-extractor normalize step) and assessment for benchmarking and last step can also be added merging all the input files given. Could be a nice feature.
https://github.com/EUCANCan/oncoliner/blob/main/modules/oncoliner_assessment/example/example_main.sh
- Lingua principale
- Nextflow
- Stelle
- 53
- Fork
- 34
- Merge medio
- 21h 27m
- PR unite (30g)
- 18
Preparare l'ambiente
Avvia il container di sviluppo del progetto nel browser, con il tuo account GitHub.
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Ha un modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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