Hacktoberfest 2026: die Issues, die Maintainer für den Oktober markiert haben – offen und einsteigerfreundlich. Hacktoberfest-Issues durchsuchen

Owner

SysBioChalmers

Zum Folgen anmelden

2 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen

Einsteigerfreundlich Alles
Offen Alle

Issues, an denen vielleicht schon jemand arbeitet, stehen am Ende. Alles nach Datum anzeigen

  • Curate r_1603: the thiamine pyrimidine (HMP-P) synthase uses PLP and histidine and needs O2
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    curation

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 55/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#424 ·

  • Reconsider small and inconsistently named subsystems
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    curation

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#420 ·

  • Ferrocytochrome b5 in the ER (s_4209) has charge 3 and ferricytochrome cross-references
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    curation

    Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 77/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#419 ·

  • Proton leak (r_2129) is unbounded and can absorb oxygen without ATP
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#418 ·

  • ecYeastGEM: enzyme-constrained model available via ecModels; automated reconstruction planned
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#416 ·

  • Curation backlog: non-blocking findings from model-qc.yml
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#408 ·

  • Problem with fillGaps function
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 45/100

    SysBioChalmers/RAVEN#608 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • KEGG-derived model without compartmentalization
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    help wanted

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 20/100

    SysBioChalmers/RAVEN#593 · 4 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • TranslateSBML_RAVEN.m fails on Apple M4
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 18/100

    SysBioChalmers/RAVEN#582 · 3 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Implement YAML-based curation
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    SysBioChalmers/yeast-GEM#379 · 2 Kommentare · 1 Reaktion · 1 zugewiesene Person ·

  • How to apply ftINIT to yeast-GEM
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 18/100

    SysBioChalmers/RAVEN#570 · 4 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Yeast-GEM visualization?
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#367 · 4 Kommentare ·

  • Is ftINIT compatible with other solvers than Gurobi?
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 22/100

    SysBioChalmers/RAVEN#548 · 2 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • PredictLocalization issue
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 15/100

    SysBioChalmers/RAVEN#545 · 1 Kommentar ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • feat: function to report if flux vector is ΔG-compatible
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#353 ·

  • duplicate metabolites identified
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 15/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#338 · 1 Kommentar ·

  • reaction references
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#334 ·

  • feat: single ec-code annotation per reaction
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    SysBioChalmers/yeast-GEM#319 · 5 Kommentare · 1 zugewiesene Person ·

  • feat: KEGG pathway annotation
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 22/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#317 · 1 Reaktion ·

  • feat: unit tests for functions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 50/100

    SysBioChalmers/RAVEN#414 ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • Feat-stoichiometry coefficients for subunits in the enzyme complex
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#297 · 10 Kommentare ·

  • Fix-amino acid pathways localization
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug wip

    SysBioChalmers/yeast-GEM#294 · 1 Kommentar · 1 zugewiesene Person ·

  • feat: have SLIMEr as option
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#289 ·

  • feat: curate grRules with GPRuler output
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    SysBioChalmers/yeast-GEM#288 · 2 zugewiesene Personen ·

  • doc: tutorial for yeast-GEM
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 40/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#286 ·

  • feat:Missing annotations for Rhea and ModelSEED database
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    help wanted

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 30/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#231 · 3 Kommentare · 1 Reaktion ·

  • fix: remove generic reactions
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    question

    Schwierigkeit 3/5 Ein halber Tag Anfängerfreundlichkeit 22/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#219 · 5 Kommentare ·

  • feat: allow contributions from python users
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    format fix standby

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 8/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#218 · 1 Kommentar ·

  • fix: mass- and charge balance reactions
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    bug help wanted

    SysBioChalmers/yeast-GEM#194 · 2 Kommentare · 1 Reaktion · 2 zugewiesene Personen ·

  • doc: update contribution guidelines
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    question

    Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 15/100

    SysBioChalmers/RAVEN#188 · 2 Kommentare ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • feat: align RAVEN and COBRA model fields
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    COBRA discussion enhancement

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 12/100

    SysBioChalmers/RAVEN#184 · 18 Kommentare · 5 Reaktionen ·

    Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag

  • fix: biomass tests from memote
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    memote standby

    Schwierigkeit 4/5 3-5 Tage Anfängerfreundlichkeit 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#138 · 1 Kommentar ·

  • fix: stoichiometric consistency due to SLIME rxns
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    help wanted memote question

    Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#135 ·

  • ATP/NADH issue
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    question

    SysBioChalmers/yeast-GEM#64 · 6 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • feat: compartment curation
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?

    SysBioChalmers/yeast-GEM#61 · 6 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • fix: flux prediction through PPP
    Evtl. wieder frei Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    help wanted

    SysBioChalmers/yeast-GEM#59 · 11 Kommentare · 2 zugewiesene Personen ·

  • feat: apply curations from mitoYeast-GEM paper
    Offen
    • Stimmt etwas nicht?
    enhancement help wanted

    Schwierigkeit 4/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#12 · 3 Kommentare ·

Neue Issues direkt in Ihr Postfach

Eine kurze Übersicht über anfängerfreundliche GitHub-Issues.