Hacktoberfest 2026：メンテナが10月に向けて印を付けた、オープンで初心者向けの issue。 Hacktoberfest の issue を見る

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SysBioChalmers

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索引済みのリポジトリ 2 件 · GitHub で見る

初心者向け すべて
オープン すべて

誰かが対応中かもしれないイシューは最後に並べています。 すべて日付順に表示

  • Curate r_1603: the thiamine pyrimidine (HMP-P) synthase uses PLP and histidine and needs O2
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    curation

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 55/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#424 ·

  • Reconsider small and inconsistently named subsystems
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    curation

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#420 ·

  • Ferrocytochrome b5 in the ER (s_4209) has charge 3 and ferricytochrome cross-references
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    curation

    難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 77/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#419 ·

  • Proton leak (r_2129) is unbounded and can absorb oxygen without ATP
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#418 ·

  • ecYeastGEM: enzyme-constrained model available via ecModels; automated reconstruction planned
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#416 ·

  • Curation backlog: non-blocking findings from model-qc.yml
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#408 ·

  • Problem with fillGaps function
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 45/100

    SysBioChalmers/RAVEN#608 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • KEGG-derived model without compartmentalization
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    help wanted

    難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 20/100

    SysBioChalmers/RAVEN#593 · コメント 4 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • TranslateSBML_RAVEN.m fails on Apple M4
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 18/100

    SysBioChalmers/RAVEN#582 · コメント 3 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Implement YAML-based curation
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    SysBioChalmers/yeast-GEM#379 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 担当者 1 名 ·

  • How to apply ftINIT to yeast-GEM
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 18/100

    SysBioChalmers/RAVEN#570 · コメント 4 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Yeast-GEM visualization?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#367 · コメント 4 件 ·

  • Is ftINIT compatible with other solvers than Gurobi?
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 22/100

    SysBioChalmers/RAVEN#548 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • PredictLocalization issue
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 15/100

    SysBioChalmers/RAVEN#545 · コメント 1 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • feat: function to report if flux vector is ΔG-compatible
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#353 ·

  • duplicate metabolites identified
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 15/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#338 · コメント 1 件 ·

  • reaction references
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#334 ·

  • feat: single ec-code annotation per reaction
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    SysBioChalmers/yeast-GEM#319 · コメント 5 件 · 担当者 1 名 ·

  • feat: KEGG pathway annotation
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 22/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#317 · リアクション 1 件 ·

  • feat: unit tests for functions
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 50/100

    SysBioChalmers/RAVEN#414 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • Feat-stoichiometry coefficients for subunits in the enzyme complex
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#297 · コメント 10 件 ·

  • Fix-amino acid pathways localization
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug wip

    SysBioChalmers/yeast-GEM#294 · コメント 1 件 · 担当者 1 名 ·

  • feat: have SLIMEr as option
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#289 ·

  • feat: curate grRules with GPRuler output
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    SysBioChalmers/yeast-GEM#288 · 担当者 2 名 ·

  • doc: tutorial for yeast-GEM
    オープン
    • 何か問題がありますか？

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 40/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#286 ·

  • feat:Missing annotations for Rhea and ModelSEED database
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    help wanted

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 30/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#231 · コメント 3 件 · リアクション 1 件 ·

  • fix: remove generic reactions
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 3/5 半日 初心者へのやさしさ 22/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#219 · コメント 5 件 ·

  • feat: allow contributions from python users
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    format fix standby

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 8/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#218 · コメント 1 件 ·

  • fix: mass- and charge balance reactions
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    bug help wanted

    SysBioChalmers/yeast-GEM#194 · コメント 2 件 · リアクション 1 件 · 担当者 2 名 ·

  • doc: update contribution guidelines
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 15/100

    SysBioChalmers/RAVEN#188 · コメント 2 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • feat: align RAVEN and COBRA model fields
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    COBRA discussion enhancement

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

    SysBioChalmers/RAVEN#184 · コメント 18 件 · リアクション 5 件 ·

    メンテナーはふだん 1 日以内に返信

  • fix: biomass tests from memote
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    memote standby

    難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#138 · コメント 1 件 ·

  • fix: stoichiometric consistency due to SLIME rxns
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    help wanted memote question

    難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 18/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#135 ·

  • ATP/NADH issue
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    question

    SysBioChalmers/yeast-GEM#64 · コメント 6 件 · 担当者 2 名 ·

  • feat: compartment curation
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？

    SysBioChalmers/yeast-GEM#61 · コメント 6 件 · 担当者 2 名 ·

  • fix: flux prediction through PPP
    再び着手できるかも オープン
    • 何か問題がありますか？
    help wanted

    SysBioChalmers/yeast-GEM#59 · コメント 11 件 · 担当者 2 名 ·

  • feat: apply curations from mitoYeast-GEM paper
    オープン
    • 何か問題がありますか？
    enhancement help wanted

    難易度 4/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 12/100

    SysBioChalmers/yeast-GEM#12 · コメント 3 件 ·

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