v2: Update validator
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Bewertung
- Schwierigkeit
- 5/5
- Geschätzter Aufwand
- Über eine Woche
- Anfängerfreundlichkeit
- 30/100
- Issue-Typ
- Feature
- Klarheit
- Muss geklärt werden
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Tech-Stack
- python
- Bereich
- backend, testing-qa
Rechercherichtung
The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.
- Readable error message
- include sufficient context in error messages
- Check for missing columns in files
- Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
- Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 18
- Forks
- 9
- Ø Merge
- 2 T. 4 Std.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 30
Entwicklungsumgebung
- Kein Dockerfile und keine Docker-Compose-Datei
- Keine Pull-Request-Vorlage
- Beitragsleitfaden lesen
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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