ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency
Bewertung
- Schwierigkeit
- 2/5
- Geschätzter Aufwand
- 1-3 Stunden
- Anfängerfreundlichkeit
- 38/100
- Issue-Typ
- Dokumentation
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Tech-Stack
- r
- Bereich
- documentation
Rechercherichtung
Beginne mit der Dokumentation von ScanVcfParam und der Beschreibung seines Konstruktors. Ermittle, ob das Argument which einen Bereich wie 1:100 unterstützt, und passe anschließend die dokumentierte Beschreibung an das tatsächliche Verhalten oder die vorgesehene Verwendung an. Die Aufgabe ist abgeschlossen, wenn Benutzer erkennen können, wie sie Datensätze vor dem vollständigen Einlesen der VCF in der Vorschau anzeigen können.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
It is defined as
A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.
But, in the constructor of ScanVcfParam
The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.
I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.
- Vorherrschende Sprache
- R
- Sterne
- 32
- Forks
- 21
- PR-Merge-Kennzahlen
- Keine gemergten PRs in 30 T.
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
Mehr aus Bioconductor/VariantAnnotation
-
refactor the packageOffen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 25/100
Bioconductor/VariantAnnotation#115 · 4 Kommentare ·
-
what is the "covr" condition of this package?Evtl. vergeben @vjcitn hat das vor 95 Tagen übernommen. Offen
Bioconductor/VariantAnnotation#114 · 1 Reaktion · 2 zugewiesene Personen ·
-
produce false positive and false negative PRsEvtl. vergeben @jmg421 hat das vor 84 Tagen übernommen. Offen
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 35/100
Bioconductor/VariantAnnotation#113 · 2 Kommentare ·
-
possible problem parsing INFO description fieldEvtl. vergeben @jmg421 hat das vor 117 Tagen übernommen. Offen
Schwierigkeit 3/5 1-2 Tage Anfängerfreundlichkeit 35/100
-
Schwierigkeit 5/5 Über eine Woche Anfängerfreundlichkeit 30/100
Bioconductor/VariantAnnotation#88 · 2 Kommentare ·
Alle Issues in Bioconductor/VariantAnnotation
Ähnliche Issues
-
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 72/100
rstudio/reticulate#1933 ·
-
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 62/100
-
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 66/100
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
-
Schwierigkeit 2/5 1-3 Stunden Anfängerfreundlichkeit 68/100
lrberge/fixest#686 · 2 Kommentare ·
Maintainer antworten meist innerhalb von 1 Tag
-
Schwierigkeit 1/5 Unter einer Stunde Anfängerfreundlichkeit 82/100