ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency
Nadie ha tomado este issue todavía.
Evaluación
- Dificultad
- 2/5
- Tiempo estimado
- 1-3 horas
- Aptitud para principiantes
- 38/100
- Tipo de issue
- Documentación
- Claridad
- Bastante claro
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- r
- Área
- documentation
Línea de trabajo
Comienza con la documentación de ScanVcfParam y la descripción de su constructor. Determina si el argumento which admite un rango como 1:100 y, a continuación, haz que la descripción documentada sea coherente con el comportamiento real o con el uso previsto. Se considera terminado cuando los usuarios puedan saber cómo previsualizar registros antes de leer el VCF completo.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
It is defined as
A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.
But, in the constructor of ScanVcfParam
The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.
I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.
- Lenguaje dominante
- R
- Estrellas
- 32
- Forks
- 21
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Guía de contribución
No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Más de Bioconductor/VariantAnnotation
-
refactor the package Abierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100
Bioconductor/VariantAnnotation#115 · 4 comentarios ·
-
Bioconductor/VariantAnnotation#114 · 1 reacción · 2 asignados ·
-
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 35/100
Bioconductor/VariantAnnotation#113 · 2 comentarios ·
-
Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100
-
ensemblVEP::parseCSQToGRanges Abierto
Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 30/100
Bioconductor/VariantAnnotation#88 · 2 comentarios ·
Todos los issues de Bioconductor/VariantAnnotation
Issues similares
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 75/100
robjhyndman/forecast#1220 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 65/100
JamesHWade/deputy#192 ·
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 75/100
-
bug triage_needed
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 75/100
-
Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 72/100
pharmaverse/rtables#1123 · 1 comentario · 1 reacción ·