ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency
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Évaluation
- Difficulté
- 2/5
- Temps estimé
- 1-3 heures
- Accessibilité débutants
- 38/100
- Type d'issue
- Documentation
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- À l'abandon
- Stack technique
- r
- Domaine
- documentation
Piste de recherche
Commencez par la documentation de ScanVcfParam et la description de son constructeur. Déterminez si l’argument which prend en charge une plage telle que 1:100, puis rendez la description documentée cohérente avec le comportement réel ou l’utilisation prévue. Le travail est terminé lorsque les utilisateurs peuvent comprendre comment prévisualiser des enregistrements avant de lire l’intégralité du VCF.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
It is defined as
A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.
But, in the constructor of ScanVcfParam
The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.
I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.
- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 32
- Forks
- 21
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Guide de contribution
Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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