ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency
Avaliação
- Dificuldade
- 2/5
- Tempo estimado
- 1-3 horas
- Facilidade para iniciantes
- 38/100
- Tipo de issue
- Documentação
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Status de atividade
- Estagnada
- Stack de tecnologia
- r
- Domínio
- documentation
Direção de pesquisa
Comece pela documentação de ScanVcfParam e pela descrição de seu construtor. Determine se o argumento which aceita um intervalo como 1:100 e, em seguida, torne a descrição documentada consistente com o comportamento real ou com o uso pretendido. A tarefa estará concluída quando os usuários puderem entender como visualizar registros antes de ler o VCF completo.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
It is defined as
A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.
But, in the constructor of ScanVcfParam
The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.
I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.
- Linguagem predominante
- R
- Estrelas
- 32
- Forks
- 21
- Métricas de merge de PRs
- Nenhum PR com merge em 30d
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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