Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency

Aperta
#34 2 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Idoneità per principianti
38/100
Tipo di issue
Documentazione
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
documentation

Direzione di ricerca

Inizia dalla documentazione di ScanVcfParam e dalla descrizione del relativo costruttore. Determina se l’argomento which supporta un intervallo come 1:100, quindi rendi la descrizione documentata coerente con il comportamento effettivo o con l’uso previsto. Il lavoro è completo quando gli utenti possono capire come visualizzare in anteprima i record prima di leggere l’intero VCF.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

It is defined as

A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.

But, in the constructor of ScanVcfParam

The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.

I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.

Lingua principale
R
Stelle
32
Fork
21
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di Bioconductor/VariantAnnotation

Tutte le issue di Bioconductor/VariantAnnotation

Issue simili

Altre issue su R

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.