ScanVcfParam which Parameter Description Inconsistency
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 2/5
- Thời gian dự kiến
- 1-3 giờ
- Mức phù hợp với người mới
- 38/100
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- r
- Lĩnh vực
- documentation
Hướng nghiên cứu
Bắt đầu với tài liệu về ScanVcfParam và phần mô tả constructor của nó. Xác định xem đối số which có hỗ trợ một phạm vi như 1:100 hay không, sau đó làm cho phần mô tả trong tài liệu nhất quán với hành vi thực tế hoặc cách sử dụng dự kiến. Hoàn thành khi người dùng có thể biết cách xem trước các bản ghi trước khi đọc toàn bộ VCF.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
It is defined as
A GRanges describing the sequences and ranges to be queried.
But, in the constructor of ScanVcfParam
The ‘which’ argument to the constructor can be one of several types, as documented above.
I am hoping that it's possible to import the first few records using a setting such as which = 1:100 before importing the entire 250 GB gnomAD VCF file to check I've got what I need for an analysis.
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 32
- Fork
- 21
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của Bioconductor/VariantAnnotation
-
refactor the package Đang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
Bioconductor/VariantAnnotation#115 · 4 bình luận ·
-
Bioconductor/VariantAnnotation#114 · 1 reaction · 2 người được giao ·
-
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 35/100
Bioconductor/VariantAnnotation#113 · 2 bình luận ·
-
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
-
ensemblVEP::parseCSQToGRanges Đang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 30/100
Bioconductor/VariantAnnotation#88 · 2 bình luận ·
Tất cả issue của Bioconductor/VariantAnnotation
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
robjhyndman/forecast#1220 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 65/100
JamesHWade/deputy#192 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
bug triage_needed
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 75/100
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
pharmaverse/rtables#1123 · 1 bình luận · 1 reaction ·