Handling KEGG Prefixes with Identical URI Resolution
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评估
调研方向
首先检查 prefix.csv 文件以及 semsql 安装中的前缀解析处理。确定 kegg.reaction 和 kegg.pathway 如何在共享 https://www.kegg.jp/entry 的同时保持彼此独立，然后验证两个前缀都能在无需手动编辑的情况下正确解析。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
KEGG Ontology Prefix Handling
We are currently using two KEGG prefixes:
- kegg.reaction (KEGG Reaction)
- kegg.pathway (KEGG Pathway)
Both of these prefixes resolve to the same base URL: https://www.kegg.jp/entry. For example:
I have been manually editing the prefix.csv files in my semsql installation to handle prefixes that are not already defined for ontologies we are currently developing. However, I'm uncertain how best to handle the KEGG prefixes given their shared resolution.
Any suggestions or guidance on a robust solution for this issue would be greatly appreciated.
- 主要语言
- Python
- 星标
- 70
- 派生
- 7
- 平均合并
- 4 小时 18 分钟
- 30 天内合并 PR
- 1
环境准备
- 提供 Dockerfile 或 Docker Compose 文件
- 没有 Pull Request 模板
- 阅读贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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