Handling KEGG Prefixes with Identical URI Resolution
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 25/100
調査の方向性
まず prefix.csv ファイルと、semsql インストールにおけるプレフィックス解決の処理を調べます。kegg.reaction と kegg.pathway が https://www.kegg.jp/entry を共有しながらも別個のままであるべき方法を特定し、その後、手動編集なしで両方のプレフィックスが正しく解決されることを確認します。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
KEGG Ontology Prefix Handling
We are currently using two KEGG prefixes:
- kegg.reaction (KEGG Reaction)
- kegg.pathway (KEGG Pathway)
Both of these prefixes resolve to the same base URL: https://www.kegg.jp/entry. For example:
I have been manually editing the prefix.csv files in my semsql installation to handle prefixes that are not already defined for ontologies we are currently developing. However, I'm uncertain how best to handle the KEGG prefixes given their shared resolution.
Any suggestions or guidance on a robust solution for this issue would be greatly appreciated.
- 主要言語
- Python
- スター
- 70
- フォーク
- 7
- 平均マージ
- 4時間 18分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
- Dockerfile または Docker Compose ファイルあり
- プルリクエストのテンプレートなし
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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