Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

Merck/BioPhi

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BioPhi is an open-source antibody design platform. It features methods for automated antibody humanization (Sapiens), humanness evaluation (OASis) and an interface for computer-assisted antibody sequence design.

Merck/BioPhi è adatto ai principianti?

Abbiamo visto troppo poche pull request recenti di contributori esterni su Merck/BioPhi per dire quanto spesso vengono accettate. Al momento non è aperta nessuna issue adatta ai principianti; l'elenco qui sotto mostra le altre issue che abbiamo per questo repository.

Stelle
267
Fork
65
Issue aperte per principianti
0
Issue indicizzate
44
Lingua principale
Python
Licenza
MIT
Ultimo push su GitHub
13/5/2025
Ultima indicizzazione
19/9/2026
Nessuna guida per i contributori
Nessun codice di condotta
Label per principianti
good first issue help wanted
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Come contribuire a Merck/BioPhi

  1. Non c'è una guida per contribuire: parti dal README e da alcune pull request accettate di recente per capire come si propongono le modifiche.
  2. Include un Dockerfile o un file Docker Compose, quindi puoi avviarlo senza installare tutta la sua toolchain.
  3. I tuoi contributi saranno pubblicati con la licenza MIT del progetto.
  4. Segui il repository per sapere quando si apre una nuova issue adatta ai principianti, oppure guarda le altre issue qui sotto.
Adatte ai principianti Tutto
Aperta Tutte

Le issue su cui forse qualcuno sta già lavorando sono in fondo alla lista. Ordina tutto per data

  • Tasks are waiting in queue...
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#89 · 1 commento ·

  • OASis local set prevalence threshold
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 57/100

    Merck/BioPhi#87 ·

  • OASis prevalence threshold for custom
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100

    Merck/BioPhi#86 ·

  • bootstrap加载优化
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#85 ·

  • The server is waiting indefinitely
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100

    Merck/BioPhi#84 ·

  • The BioPhi server is not working
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#83 ·

  • Error: [Errno 24] Too many open files: '/tmp/tmps9os6anr.fasta'
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#82 · 2 commenti ·

  • BioPhi failed with TypeError: predict_scores() got an unexpected keyword argument 'model_version'
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#81 · 1 commento ·

  • The biophi server is not working!
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#80 ·

  • Cannot get image from quay.io
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#79 · 3 commenti ·

  • Error: [Errno 12] Cannot allocate memory
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#78 · 1 commento ·

  • Tasks waiting in queue indefinitely
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#77 · 5 commenti ·

  • Tasks are still waiting in queue... indefintiely
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#76 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely...not a repeat ticket
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    Merck/BioPhi#75 ·

  • No processing occurs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    Merck/BioPhi#73 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#72 ·

  • Task waiting in queue
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    Merck/BioPhi#71 ·

  • Error when exporting Full Table from Humanization results
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#68 ·

  • how to set the OASis prevalence threshold when using biophi on command line?
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#66 ·

  • Simplified server installation issue
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    Merck/BioPhi#65 ·

  • Control number of mutations when humanizing
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#64 ·

  • Cannot build docker
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#54 ·

  • Integration of additional language models?
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#53 ·

  • how to get raw peptide data(sequence datasets)?
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

    Merck/BioPhi#52 ·

  • Smaller docker images
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#50 ·

  • Allowing humanization to make multiple outputs
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#47 ·

  • Enable cli for humanization cdr grafting
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#46 ·

  • Add mypy type checks
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#45 ·

  • BioPhi failed with HMMscanError: b'Parse failed (sequence file /var/folders/j7/j8sdcdk16nn_ngnyt1nc9vlw0000gn/T/tmpuhcuvvsc.fasta):\nLine 3: illegal character }\n\n' 0it [00:00, ?it/s]
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#43 ·

  • Error: module 'numpy' has no attribute 'int'
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#42 · 5 commenti ·

  • Specify pandas version
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#40 · 1 commento ·

  • Specify flask version
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#35 ·

  • Error: Invalid sequence for "antibody"
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#34 ·

  • Observation and Fix: Sqlalchemy 2.0 Compatibility - Downgrade to Sqlalchemy 1.x
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    Merck/BioPhi#33 · 1 reazione ·

  • Navigation arrows between individual results
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement good first issue

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#15 ·

  • Enable generating multiple humanized sequence variants at once
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#13 ·

  • Simplify export of suggested mutations from Designer
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 20/100

    Merck/BioPhi#12 ·

  • Problems about human germline sequence
    Aperta
    • Qualcosa non va?

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#9 · 4 commenti ·

  • Provide instructions on mounting OASis database through Docker
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    documentation good first issue help wanted

    Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 42/100

    Merck/BioPhi#8 ·

  • Implement shopping cart functionality in Designer
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#5 ·

  • Humanization Benchmark Data Availability
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    question

    Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

    Merck/BioPhi#4 · 2 commenti ·

  • Highlight mutations in humanization screen same as in the Designer
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

    Merck/BioPhi#3 ·

  • Implement sorting on the backend
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement good first issue help wanted

    Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

    Merck/BioPhi#2 ·

  • Add number of mutations to humanization & designer panel
    Aperta
    • Qualcosa non va?
    enhancement

    Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

    Merck/BioPhi#1 ·

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