Problems about human germline sequence
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 35/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia riproducendo la discrepanza per IGKV2-30*01 nel modulo di umanizzazione di BioPhi e confrontala con il FASTA di riferimento IMGT collegato nel report. Traccia quale fonte delle sequenze dei geni V e J germinali utilizza il modulo; il lavoro è completato quando è stato identificato se la discrepanza è un errore e la discrepanza della fonte è stata corretta o documentata con copertura di regressione.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
While using humanization module at https://biophi.dichlab.org/, I found the sequence of IGKV2-30*01 was different from the sequence from http://www.imgt.org/download/GENE-DB/IMGTGENEDB-ReferenceSequences.fasta-AA-WithoutGaps-F+ORF+inframeP .The second sequence was copied from the biophi web page.
Maybe there are some errors with your human germline V and J gene sequences.
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 267
- Fork
- 65
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Include un Dockerfile o un file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Nessuna guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
Altre issue di Merck/BioPhi
-
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 57/100
-
Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 48/100
-
bootstrap加载优化Aperta
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100
-
Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 15/100
Tutte le issue di Merck/BioPhi
Issue simili
-
HTML: <template> content is extracted as document textForse già presa @ryanmeowy l’ha presa oggi. Apertabug html
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 82/100
docling-project/docling#4714 · 2 commenti ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
[BUG] Qdrant RAG client applies score_threshold to raw cosine similarity, not the 0-1 score it returnsForse già presa @roydonsequeira l’ha presa oggi. Apertabug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 70/100
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 72/100
ashhart/TensorFold#536 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
area/install-update comp/cli duplicate P2 python:uv sweeper:risk-compatibility type/bug
Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 62/100
NousResearch/hermes-agent#135440 · 1 commento ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
-
bug
Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 85/100
Deepak3699/Ai_Mentor#244 ·
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno