OASis prevalence threshold for custom
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Valutazione
- Difficoltà
- 3/5
- Tempo stimato
- 1-2 giorni
- Idoneità per principianti
- 48/100
- Tipo di issue
- Bug
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Tranquilla
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia riproducendo il problema con una soglia di prevalenza OASis personalizzata, ad esempio 5%, e verifica come viene rappresentata la soglia nel file XLSX di output. Segui la gestione della soglia e la generazione dell'output per determinare perché i valori non standard vengono etichettati come strict; il lavoro è completato quando i valori personalizzati vengono riportati correttamente.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Currently, OASis prevalence threshold settings:
loose (≥1% subjects)
relaxed (≥10% subjects)
medium (≥50% subjects)
strict (≥90% subjects)
custom
When I set a 5% as custom threshold, the threshold field in the output xlsx file is strict, rather than loose.
I tried other values, rather than 1,10,50,90, all threshold field in the output xlsx file is strict.
Could someone explain this for me?
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 268
- Fork
- 65
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Include un Dockerfile o un file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Nessuna guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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