Hacktoberfest 2026: as issues que os mantenedores marcaram para outubro, abertas e boas para iniciantes. Ver issues do Hacktoberfest

Merck/BioPhi

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BioPhi is an open-source antibody design platform. It features methods for automated antibody humanization (Sapiens), humanness evaluation (OASis) and an interface for computer-assisted antibody sequence design.

Merck/BioPhi é bom para iniciantes?

Vimos poucos pull requests recentes de contribuidores externos em Merck/BioPhi para dizer com que frequência eles recebem merge. No momento não há nenhuma issue para iniciantes aberta; a lista abaixo mostra as outras issues que temos deste repositório.

Estrelas
267
Forks
65
Issues abertas para iniciantes
0
Issues indexadas
44
Linguagem predominante
Python
Licença
MIT
Último push no GitHub
13/5/2025
Última indexação
19/9/2026
Sem guia de contribuição
Sem código de conduta
Labels para iniciantes
good first issue help wanted
Nenhum PR com merge em 30d

Como contribuir com Merck/BioPhi

  1. Não há guia de contribuição, então comece pelo README e por alguns pull requests com merge recente para ver como as mudanças são propostas.
  2. Ele tem um Dockerfile ou um arquivo Docker Compose, então você pode rodá-lo sem instalar todo o conjunto de ferramentas.
  3. Suas contribuições serão publicadas sob a licença MIT do projeto.
  4. Siga o repositório para saber quando uma nova issue para iniciantes for aberta, ou veja as outras issues abaixo.
Para iniciantes Tudo
Abertas Todas

Issues em que talvez alguém já esteja trabalhando aparecem no fim. Ordenar tudo por data

  • Tasks are waiting in queue...
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#89 · 1 comentário ·

  • OASis local set prevalence threshold
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 57/100

    Merck/BioPhi#87 ·

  • OASis prevalence threshold for custom
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 48/100

    Merck/BioPhi#86 ·

  • bootstrap加载优化
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#85 ·

  • The server is waiting indefinitely
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 15/100

    Merck/BioPhi#84 ·

  • The BioPhi server is not working
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#83 ·

  • Error: [Errno 24] Too many open files: '/tmp/tmps9os6anr.fasta'
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#82 · 2 comentários ·

  • BioPhi failed with TypeError: predict_scores() got an unexpected keyword argument 'model_version'
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#81 · 1 comentário ·

  • The biophi server is not working!
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#80 ·

  • Cannot get image from quay.io
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#79 · 3 comentários ·

  • Error: [Errno 12] Cannot allocate memory
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#78 · 1 comentário ·

  • Tasks waiting in queue indefinitely
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#77 · 5 comentários ·

  • Tasks are still waiting in queue... indefintiely
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#76 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely...not a repeat ticket
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

    Merck/BioPhi#75 ·

  • No processing occurs
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

    Merck/BioPhi#73 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#72 ·

  • Task waiting in queue
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

    Merck/BioPhi#71 ·

  • Error when exporting Full Table from Humanization results
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#68 ·

  • how to set the OASis prevalence threshold when using biophi on command line?
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#66 ·

  • Simplified server installation issue
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

    Merck/BioPhi#65 ·

  • Control number of mutations when humanizing
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#64 ·

  • Cannot build docker
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#54 ·

  • Integration of additional language models?
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#53 ·

  • how to get raw peptide data(sequence datasets)?
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 15/100

    Merck/BioPhi#52 ·

  • Smaller docker images
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#50 ·

  • Allowing humanization to make multiple outputs
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#47 ·

  • Enable cli for humanization cdr grafting
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#46 ·

  • Add mypy type checks
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#45 ·

  • BioPhi failed with HMMscanError: b'Parse failed (sequence file /var/folders/j7/j8sdcdk16nn_ngnyt1nc9vlw0000gn/T/tmpuhcuvvsc.fasta):\nLine 3: illegal character }\n\n' 0it [00:00, ?it/s]
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#43 ·

  • Error: module 'numpy' has no attribute 'int'
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#42 · 5 comentários ·

  • Specify pandas version
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#40 · 1 comentário ·

  • Specify flask version
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#35 ·

  • Error: Invalid sequence for "antibody"
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#34 ·

  • Observation and Fix: Sqlalchemy 2.0 Compatibility - Downgrade to Sqlalchemy 1.x
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    Merck/BioPhi#33 · 1 reação ·

  • Navigation arrows between individual results
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement good first issue

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#15 ·

  • Enable generating multiple humanized sequence variants at once
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#13 ·

  • Simplify export of suggested mutations from Designer
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 20/100

    Merck/BioPhi#12 ·

  • Problems about human germline sequence
    Aberta
    • Algo errado?

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#9 · 4 comentários ·

  • Provide instructions on mounting OASis database through Docker
    Aberta
    • Algo errado?
    documentation good first issue help wanted

    Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 42/100

    Merck/BioPhi#8 ·

  • Implement shopping cart functionality in Designer
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#5 ·

  • Humanization Benchmark Data Availability
    Aberta
    • Algo errado?
    question

    Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

    Merck/BioPhi#4 · 2 comentários ·

  • Highlight mutations in humanization screen same as in the Designer
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

    Merck/BioPhi#3 ·

  • Implement sorting on the backend
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement good first issue help wanted

    Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

    Merck/BioPhi#2 ·

  • Add number of mutations to humanization & designer panel
    Aberta
    • Algo errado?
    enhancement

    Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

    Merck/BioPhi#1 ·

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